（中央社记者林惠君台北二十四日电）前总统陈水扁在2004年10月提出“限时限量”二次金改目标，其中，数个整并案引发外界高度质疑，包括台新金标购彰银特别股、中信金插旗兆丰金、开发金经营权之争、华南金董监改选等。但金管会日前调查二次金改多项整并案，认为行政程序还算完备，没有重大瑕疪。
陈水扁2004年底宣示二次金改目标，包括2005年底前促成三家金融机构市占率达到10%以上；2005年底前将当时公股金融机构家数由12家减为6家；2006年底前国内14家金控减半；2006年底前至少促成一家金融机构由外资经营或是在国外挂牌上市。
二次金改推动整并过程中，有几个案子受到外界高度关切与质疑。
“彰化银行14亿股特别股增资案”，2005年彰银发行海外存托凭证（GDR）失败，改以特别股方式释出公股股权，台新银行以每股26.12元得标（底标17.98元），总得标金额为新台币365.68亿元。外界质疑，台新金买下彰银GDR后，居然以特别股股东持有彰银过半董监席次。
“中信金控插旗兆丰金控”事件，2006年2月金管会核准通过中信金控购买10%兆丰金控股权，中信金在2006年6月举行的兆丰金股东会中取得过半董监席次，并引起时任行政院副院长的蔡英文震怒。
不过，中信金2006年7月遭金管会查核发现其购买海外结构债连结兆丰金股权的缺失，并要求将其以结构债方式取得的兆丰金股权陆续释出。
“开发金控经营权之争”，2004年辜家与时任开发金董事长的陈敏薰争夺开发金经营权，最后辜家胜出。外传辜家曾进官邸求见吴淑珍。2007年6月开发金董监改选，公股大挫败，主导经营权的辜家取得8席董事及2席监察人，并拿下2席独立董事，确定占得董事会3分之2席次版图。公股席次则为4董1监及1席独立董事。
“华南金控董监改选”，2007年6月15日，财政部掌握华南金股权38%，但因征求委托书方面不及民股林明成（华南金董事长），相差8%，财部与民股协商，公股不推出董事长候选人，主要民股礼让财政部一到两席董监事席次。
陈水扁疑似海外密帐案受到外界高度关切，部分媒体推测，资金来源可能是二次金改的企业主政治献金。行政院已全面检讨二次金改合并案是否有违法情事。
行政院金融监督管理委员会主委陈树日前表示，已完成相关调查，台新金并彰银、中信金并兆丰金、开发金并金鼎证、中信证入主开发金等购并案，行政程序还算完备，没有重大瑕疵，将向政院报告。
至于与前总统陈水扁家族疑似密帐资金有关的调查，陈树表示，其他若涉及司法处理案件，已在司法程序处理中，金管会会配合调查。
根据台湾证券交易所资料显示，台新金控董事长为吴东亮、总经理为林克孝，实收资本额698亿8077万8680元。彰化银行董事长李庸三、总经理陈淮舟，实收资本额620亿9475万6000元。
中信金控董事长辜濂松、总经理陈佳文，实收资本额915亿9682万9910元。兆丰金控董事长王荣周、总经理徐光曦，实收资本额1105亿9426万2380元
开发金控董事长林诚一、总经理辜仲莹，实收资本额1096亿2062万6790元。华南金控董事长林明成、总经理李正义，实收资本额597亿208万6360元。
