來自《明報》的消息說，日前中共國家新聞出版廣電總局給該雜誌下達了書面警示書，指其創年刊登的多篇文章違規，事先未向上級主管備案審查。同時，上級部門還對《炎黃春秋》採取了釜底抽薪的辦法，現任總編輯、新華社退休高級記者楊繼繩被要求離開現任崗位。據悉，新華社已派人與楊繼繩談話，要求他必須退出雜誌編輯部，否則退休待遇等將受影響。
眾所周知，《炎黃春秋》是中共開明元老和退休官員所創辦的一份具有自由主義傾向的人文雜誌，主要刊載古今中外的歷史記述及評論文章。二十多年來，在當局實行意識形態嚴格管制的情形下，這份雜誌始終堅持還原歷史真相，不僅刊登了大量披露中共黨史內幕的文章，而且積極宣揚推進黨內改革和中國的民主進程，因其敢言的鮮明風格既贏得了讀者的好評，也給自己惹來了諸多麻煩，多次遭到官方的整肅和刁難。
2008年11月，北京知情消息人士傳出消息，由於《炎黃春秋》多次刊登涉及前中共中央總書記趙紫陽的文章，引起江澤民不滿。由於江擔心自己的影響會因此被削弱，甚至被否定，所以要求時任中共中央政治局常委李長春嚴肅處置。故文化部以雜誌相關人員年齡過大勸其退休。但在時任中共中央總書記胡錦濤的干預下，當時的社長杜導正得以繼續任職。
2009年5月22日起，炎黃春秋網站開始無法訪問，據推測可能與六四事件20周年臨近有關，至5月25日下午網站恢復正常。不久（截止5月30日14:00）該網站的炎黃論壇顯示「設置資料不存在，調用已終止」而無法訪問。5月31日論壇恢復正常。
2013年1月4日9時左右，炎黃春秋網站被關閉。炎黃春秋編輯部在新浪微博中稱，2012年12月31日分別收到署名為「工業和資訊化部網站備案系統」的短信和郵件：「您備案資訊中的網站《炎黃春秋網》已被註銷，該網站的備案號‘京ICP備08100492號-1’已被收回。特此通知！」但通知中沒有注明網站被突然註銷的原因。1月5日，炎黃春秋網站使用一個預備網站暫時恢復上線。
去年9月，上級部門急切要求《炎黃春秋》雜誌社更換主管機構，為此6名退休官員曾連署致函國家主席習近平，希望當局能給予《炎黃春秋》更多自主空間。當時，對於雜誌社的未來楊繼繩便直言，「我們死定了」。
從最近這次的整肅來風波看，《炎黃春秋》確乎是「死定了」，只是何時死，怎麼個死法目前還不確定罷了。
想當年八年抗戰時，我們的前輩曾感歎「華北之大已安放不下一張課桌」！他們哪裡又會料到，時隔半個多世紀的今天，中國之大，居然容不下一份《炎黃春秋》！！
